Preparación de Reactivos

Recetas de las soluciones y reguladores usados en los protocolos del laboratorio, agrupadas por práctica de origen. Esteriliza en autoclave (15 lb/in², 20 min) donde se indique, y usa agua destilada o desionizada salvo que se especifique lo contrario.

Soluciones generales

EDTA 0.5 M, pH 8.0

93.05 g de Na₂EDTA·2H₂O en 300 mL de agua. Ajustar pH a 8.0 con NaOH 10 M (~25 mL): el EDTA no se disuelve hasta pH ≈ 7.0. Aforar a 500 mL y autoclavar.

MgCl₂ 1 M

203.3 g de MgCl₂·6H₂O en 800 mL de agua; aforar a 1 L. Autoclavar en alícuotas.

Fenol-cloroformo

Mezclar volúmenes iguales de fenol y cloroformo; equilibrar con varias extracciones de Tris-Cl 0.1 M pH 7.6. Almacenar a 4 °C en botellas ámbar bajo una capa de Tris-Cl 0.01 M. Precaución: el fenol es altamente corrosivo — guantes y lentes.

PBS (regulador de fosfatos)

8 g NaCl, 0.2 g KCl, 1.44 g Na₂HPO₄ y 0.24 g KH₂PO₄ en 800 mL de agua. Ajustar pH a 7.4 con HCl, aforar a 1 L, autoclavar 20 min.

Etanol al 70%

70 mL de etanol absoluto + 30 mL de agua desionizada estéril. Conservar en refrigeración.

TAE 50X

242 g de Tris base en 300 mL de agua + 57.1 mL de ácido acético glacial + 100 mL de EDTA 0.5 M pH 8.0. Aforar a 1 L.

TPE 10X

108 g de Tris base en 400 mL de agua + 15.5 mL de ácido fosfórico al 85% + 40 mL de EDTA 0.5 M pH 8.0. Aforar a 1 L.

Regulador alcalino 1X

A 200 mL de agua añadir 5 mL de NaOH 10 N y 2 mL de EDTA 0.5 M pH 8.0. Aforar a 1 L.

Tris-glicina 5X (SDS-PAGE)

15.1 g de Tris base + 94 g de glicina + 50 mL de SDS 10% (pH 8.0) en 500 mL de agua. Aforar a 1 L.

Extracción de DNA (total y plasmídico)

Caldo LB

10 g de triptona, 5 g de extracto de levadura, 5 g de NaCl; ~500 mL de agua + 1 mL de NaOH 1 N. Aforar a 1 L y autoclavar.

Agar LB (placas)

Igual que el caldo + 15 g de agar bacteriológico. Autoclavar, vaciar ~20 mL por caja Petri y secar 3 días a temperatura ambiente (o 1 h a 37 °C con la tapa entreabierta).

TE 10X

0.5 mL de Tris-Cl 2 M pH 7.4 + 0.2 mL de EDTA 0.5 M pH 8.0 + 99.48 mL de agua. Autoclavar.

Tris 2 M, pH 7.4

242.2 g de Tris base en 700 mL de agua; ajustar pH con ~140 mL de HCl concentrado. Aforar a 1 L y autoclavar.

GTE (glucosa 50 mM, Tris 25 mM, EDTA 10 mM)

0.5 mL de Tris 1 M + 0.4 mL de EDTA 0.5 M + 1 mL de glucosa al 18% + 18 mL de agua estéril. Conservar en refrigeración.

Lisis alcalina (NaOH 0.2 M, SDS 1%)

1 mL de NaOH 2 M + 1 mL de SDS 10% + 8 mL de agua.

NaOH 2 M

8 g de NaOH, con mucho cuidado, en volumen final de 100 mL de agua.

SDS 10%

100 g de SDS en 800 mL de agua (a 50 °C disuelve más rápido); ajustar pH 7.0 con HCl y aforar a 1 L. Usar mascarilla al pesar: no inhalar el polvo. No requiere esterilización.

Acetato de potasio (K⁺ 3 M, acetato 5 M)

29.4 g de acetato de potasio + 11.5 mL de ácido acético glacial; aforar a 100 mL.

Acetato de potasio 5 M, pH 4.8

122.68 g en 200 mL de agua; ajustar pH a 4.8 con ácido acético y aforar a 250 mL.

Fenol saturado

Equilibrar fenol recién fundido con Tris-Cl 2 M pH 7.4 (dos veces), dejando una capa acuosa final cubriendo el fenol. Conservar en frasco ámbar, en frío.

RNasa 10 mg/mL

50 mg de RNasa pancreática en 5 mL de agua estéril; hervir 30 min para inactivar DNasas residuales. Aliquotar y guardar a −20 °C.

Proteinasa K 20 mg/mL

20 mg en 1 mL de agua bidestilada estéril.

Electroforesis y restricción

TBE 10X

54.45 g de Tris base + 27.8 g de ácido bórico + 25 mL de EDTA 0.5 M pH 8.0 en 150 mL de agua; aforar a 250 mL. (Versión 1 L: 80 g Tris, 55 g ácido bórico, 9.3 g EDTA.)

Agarosa 1% / 1.2% / 1.5% / 2%

0.35 / 0.42 / 0.525 / 0.7 g de agarosa en 35 mL de TBE 0.5X; calentar a ebullición en microondas sin sobrecalentar. Usar guantes: el gel caliente quema.

Regulador de carga

0.03 g de azul de bromofenol en 10 mL de agua + 60 mL de glicerol; aforar a 100 mL y esterilizar por filtración. (Versión 6X: 0.25 g de bromofenol + 0.25 g de xileno cianol + 30 mL de glicerol, aforar a 100 mL.)

Regulador para EcoRI 10X

Tris-HCl 1 M, NaCl 500 mM, MgCl₂ 100 mM, Tritón X-100 0.25%, pH 7.5.

Bromuro de etidio (solución de tinción)

5 µL de EtBr 10 mg/mL en 100 mL de TBE 0.5X. Carcinógeno: guantes siempre, desecho en recipiente etiquetado, nunca a la tarja.

Clonación en E. coli

LB + ampicilina + X-Gal (placas)

Preparar agar LB y añadir ampicilina y X-Gal hasta 50 µg/mL final de cada uno.

Ampicilina 4 mg/mL (stock)

40 mg de ampicilina base en 10 mL de agua estéril (condiciones de esterilidad). Conservar a 4 °C. Final en placas/medio: 50 µg/mL.

X-Gal 50 mg/mL (stock)

500 mg en 10 mL de N,N′-dimetilformamida. Añadir el volumen necesario para 50 µg/mL finales.

CaCl₂ 0.1 M

2.77 g de CaCl₂ en 250 mL de agua bidestilada. Estéril y frío para las células competentes.

PCR

MgCl₂ 50 mM

0.48 g de MgCl₂ en 100 mL de agua bidestilada.

RNA

Agua tratada con DEPC 0.1%

0.1 mL de dietil pirocarbonato en 99.9 mL de agua; incubar a 37 °C durante 1 h y autoclavar (destruye el DEPC residual). El DEPC es un alquilante: manejar en campana.

Acetato de sodio 1 M

8.2 g de acetato de sodio en 80 mL de agua bidestilada; aforar a 100 mL.

Recetas del Apéndice I del manual de laboratorio. Verifica las concentraciones de los stocks comerciales antes de calcular diluciones — usa la calculadora de Diluciones.